美國國衛院（NIH）早在2018年設置數據長（Chief Data Officer）一職和資料策略辦公室（ODSS），來建立標準化生醫資料處理流程。隔年，北醫也在北醫大下設置數據處，統籌三家附屬醫院和學校的資料管理工作。
北醫大數據處打理的資料類型，包括：三家醫院近380萬名病患的臨床資料；數據處負責資料格式轉換的跨國研究聯盟資料；作為教學及研究材料的外部開放資料，以及健保資料庫分中心經營。
數據處下設四大中心，健康暨臨床研究資料加值中心負責維運北醫大健保資料庫分中心；臨床數據中心負責整合三家醫院的電子病歷資料；生物資訊中心專攻精準醫療；校務研究中心負責教育數據處理。
數據處遵循敏捷開發Scrum精神，以每個專案最少3人、最多7人的規模建置資料集；也提供AI工具，如一套開源自然語言處理（NLP）模型，來優化醫院的臨床作業流程。
數據處秉持四大原則，首先是取得病人知情同意書的「資料合法性」，再來是讓患者能選擇資料用途的「多元機制」原則，第三個是依病人意願保障「退出權利」，最後是與資訊處密切合作，確保資料「隱私安全」。
數據處下一步鎖定跨國研究目標來推動FHIR應用，特別是癌症研究及基因資料的FHIR化。
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