每家醫療機構都有自家的資料記錄標準，這種情況不僅造成了資料交換的混亂，更阻礙了醫療服務品質的提升。健保署副署長龐一鳴於任職衛福部資訊處處長時曾提到，不論是醫院之間的病歷資料交換，或是醫院與主管機關或其他政府機構的資料互通，資料交換格式常常不一致。這種不一致性導致即便資料內容相似，醫院也必須按照不同機關的要求，重複製作同一份資料，增加了大量的工作負擔。
病歷資料交換互通的過程中，整合時間可分為三個等級：
C等級（低互通性）：當雙方系統採用不同標準時，需進行「介接協商」，針對不同介面逐案協調並訂製解決方案，通常耗時數個月。
B等級（標準化）：雙方系統採用標準介面，整合較簡單，儘管仍需一些配置，但時間可縮短至數日，資源投入相對較少。
A等級（高度互操作性）：雙方系統具備互操作性，採用相同標準介面，資料可即時互通，整合時間縮短至秒，實現「隨插即用」。
為了解決病歷資訊無法整合的問題，建議以國際 FHIR 標準（快速醫療互通資源）為基礎，來建立醫院資訊系統(HIS)的資料結構，並開發次世代醫療數位平台。FHIR 標準由全球數百位醫療專家共同制定，未來也能幫助台灣醫療系統與國際接軌，促進更高效的資訊交換和無縫互操作性。
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